近日,我校生命科学学院、资源学院等在自然指数期刊、英国皇家学会会刊《Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences》(《英国皇家学会学报 B-生物科学》)上发表题为“An integrated gut phage catalogue of nonhuman primates reveals functional adaptation to host ecology and evolutionary link to humans”(《非人灵长类肠道噬菌体目录揭示其对宿主生态的功能适应及与人类的进化关联》)的研究论文。
非人灵长类动物与人类亲缘关系密切,是生物医学和生态学研究中的关键模型。动物的肠道噬菌体是肠道微生物群落的关键调控因子,影响着肠道微生物的结构和功能,但对非人灵长类肠道噬菌体缺乏全面认识。该研究基于25种非人灵长类的454个肠道宏基因组数据,构建了包含11389个非冗余噬菌体基因组目录,系统解析了非人灵长类肠道噬菌体的多样性、组成及功能特征。研究发现非人灵长类肠道噬菌体的组成和功能显著受宿主进化支系(狐猴类、新大陆猴、旧大陆猴、猿类)、饮食类型(食叶类、非食叶类)和生活方式(圈养、半野生、野生)影响。宿主支系对肠道噬菌体多样性的影响强于饮食生态位,生活方式不仅影响肠道噬菌体多样性,也改变了噬菌体的辅助代谢基因功能。比较分析发现,78.5%的噬菌体可在人类肠道中检测到,且在非工业化国家人群肠道中的流行率显著更高。crAss-like噬菌体作为最常见的人类相关噬菌体,在非人灵长类肠道中同样丰富,但其与人类crAss-like噬菌体存在明显的进化差异。该研究全面阐述了非人灵长类肠道噬菌体组,揭示了宿主和环境驱动了肠道噬菌体的功能适应,为理解灵长类肠道噬菌体进化提供了重要资源。

四川农业大学为该论文第一完成单位,生命科学学院杨盛智特聘副教授为第一作者,生命科学学院徐怀亮教授和资源学院邹立扣教授为共同通讯作者。该研究得到四川省科技计划项目(2024NSFSC1284)和四川农业大学科研基金资助。