近日，四川农业大学动物医学院细菌耐药性传播与防控团队在国际期刊Environment International上发表研究论文。本研究首次构建全球奇异变形杆菌基因组研究主体数据集，通过已搭建的生信分析平台进行规模化分析，进一步结合贝叶斯进化分析、泛基因组关联分析及可移动遗传原件祖先状态重建等生信技术，揭示了奇异变形杆菌在不同国家、宿主的流行、分布特征和耐药基因转移的驱动因素，旨在为动物源细菌耐药性研究和防控提供重要数据支撑。
近年来，抗生素的不合理使用导致耐药基因全球传播，对公共卫生安全产生严重威胁。奇异变形杆菌作为肠杆菌属重要病原体，一方面是尿路感染的主要致病菌，另一方面也可污染畜禽肉制品引发食源性疾病。随着临床和畜牧业监测力量增强，发现该类菌耐药问题日益加重：碳青霉烯类耐药基因blaNDM、blaKPC及其它重要耐药基因mcr-1、tmexCD3-torJ1b相继出现在奇异变形杆菌中，且这些基因通过质粒、接合性整合元件及前噬菌体快速传播。
论文配图 四川农业大学供图
本论文基于“One Health”理念，首次聚焦全球奇异变形杆菌基因组耐药特性研究，其结果揭示：中国源及畜禽源菌株的耐药性呈现显著上升趋势，产超广谱β-内酰胺酶和碳青霉烯酶阳性菌株加速涌现。研究证实该菌存在跨国界、跨宿主克隆传播，且插入序列、质粒和接合性整合元件是奇异变形杆菌耐药基因扩散的三大关键载体。尽管当前公共基因组数据存在区域研究不均衡的局限性，但随着全球耐药防控体系完善，基因组监测技术将推动更精准的预警。基于严峻形势，呼吁将奇异变形杆菌列为耐药传播指示菌之一，为全面遏制耐药基因传播提供新抓手和新见解。
四川农业大学为该论文的唯一完成单位。该研究得到了国家重点研发计划项目、国家现代农业产业技术体系专项基金、四川省兽药创新团队项目等资助。
相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.envint.2025.109487
