6月17日,美国俄亥俄州立大学分子遗传学系区树俊教授受邀到学校草业科技学院访问交流并作客“草苑讲坛”,做了题为“Differences in activity and stability drive LTR retrotransposon accumulation in tropical vs. temperate maize(在热带与温带玉米中,活性和稳定性的差异驱动了LTR逆转录转座子的积累)”的学术报告。草业科技学院院长黄琳凯教授、严海东特聘教授、水稻所钦鹏教授、孙昌辉教授等老师以及部分研究生参加了交流。
报告会上,区树俊教授就LTR转座子在热带与温带玉米中积累进行了一定的分析,发现此类转座子的扩增和减少的机制,并且转座子的积累和其跳跃的时间,表达、表观修饰和群体分布密切相关。与会师生结合自身相关课题对转座子在群体多态性方面等问题进行了深入交流,双方今后将在草类植物转座子研究等方面进一步加强合作。
访问期间,区树俊教授还参观了草业科技学院实验室。
主讲人简介:
区树俊,美国俄亥俄州立大学分子遗传系计算生物学Assistant Professor。2018年博士毕业于密西根州立大学,植物遗传与进化专业。随后分别在爱荷华州立大学和约翰斯·霍普金斯大学从事博士后。2023年在俄亥俄州立大学组建实验室,任独立PI。区树俊教授长期致力于研究转座子(Transposable element,TE)的进化及其活动对生物功能(抗逆、环境适应以及物种形成)的贡献。其开发一系列广泛使用的TE注释和分析工具,推动了高质量基因组时代转座子研究的革新,包括灵敏和准确的注释LTR反转录转座子的LTR_retriever;用于de novo注释全基因组转座子的EDTA;用于评估转座子组装质量的LAI等。区教授在植物基因组组装算法和进化生物学方面也具有很深造诣,迄今为止,在包括Nature、Science、Cell、Nature Genetics、Nature Communications、Genome Biology等权威期刊上参与发表近50篇高水平研究论文,被引用7300余次。